El Santuario Ingi Ande alberga una diversidad de ecosistemas que reflejan su riqueza ambiental y altitudinal. Entre ellos destacan el Bosque Montano, el Bosque Húmedo Tropical, el Bosque Alto Andino y el Páramo, cada uno con características únicas que contribuyen a la biodiversidad y los servicios ecosistémicos de la región. Estos ecosistemas no solo sostienen una abundante flora y fauna, sino que también conectan las regiones andina y amazónica en un equilibrio natural vital.

El Santuario de Flora Plantas Medicinales Orito Ingi Ande es el hábitat de jaguares (Panthera onca), pumas (Puma concolor), tigrillos (Leopardus pardalis), boas (Boa constrictor) y tentes (Psophia crepitans), especies categorizadas como en preocupación menor según los criterios de la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN), así mismo, es el hogar monos chorongos (Lagothrix lagothricha), osos andinos (Tremarctos ornatus) y dantas (Tapirus terrestris), especies categorizadas como vulnerables según los criterios de la UICN. La presencia de esta fauna evidencia el alto estado de conservación de los bosques en el AP, además de su importancia ecológica y cultural para los pueblos indígenas asociados a la cultura del Yagé.

La razón de ser del AP y la creación del Santuario de Plantas Medicinales es la presencia de plantas de un alto valor cultural para las comunidades indígenas asociadas a la cultura del Yagé, como lo son el bejuco del yoco (Paulinia yoco) que es utilizado por los pueblos Siona, Cofán, Coreguaje e Inga, quienes lo consideran estimulante, purgante y medicinal. Esta planta se encuentra en peligro a nivel local, siendo escasa en los resguardos por lo cual representa un interés a nivel mundial su conservación.

También podemos encontrar Yagé (Banisteriopsis caapi), Tigre huasca (Aristolochia ruiziana), Feriri (Potalia resinífera), Yagé uco (Diplopterys cabrerana), Khushasi (Monolena Primuliflora) y Fiyupa kwpakhu (Calathea gandersii), especie categorizada como vulnerable según los criterios de la UICN. También encontramos Oreja de negro (Geogenathus ciliatus), Churusi (Palicourea rhodothamna), Chinisi (Solanum anisophyllum), Shendw (Tournefortia gigantifolia), especies categorizadas como en preocupación menor según los criterios de la UICN. Todas estas plantas forman parte de la medicina tradicional del pueblo Cofan y son usadas en su ritualidad de curación. Las plantas medicinales de la Cultura del Yagé son una muestra de la fuerte relación entre cultura y biodiversidad, para el Santuario de Flora Plantas Medicinales Orito Ingi Ande, su conservación representa un elemento fundamental en el manejo de los ecosistemas junto a las comunidades.

El Santuario de Flora Plantas Medicinales Orito Ingi Ande es importante para Colombia y el mundo porque es la única AP que cuida las plantas medicinales asociadas a la cultura del Yagé, lo que representa la permanencia del conocimiento y la cultura de los pueblos Siona, Coreguaje, Cofán, Katmensa e Inga, quienes ancestralmente han usado ese territorio como fuente de conocimiento. Igualmente, representa un espacio para el fortalecimiento de prácticas culturales asociadas a la medicina ancestral y a la conectividad ecológica entre Andes y Amazonía.

Por otro lado, Los Curacas y las abuelas del Pueblo Cofán son ampliamente conocidos y conocidas por sus saberes ancestrales sobre el uso medicinal de las plantas asociadas a la cultura del Yagé, es por eso que el Santuario de Flora Plantas Medicinales Orito Ingi Ande trabaja junto a ellos en la conservación de esas relaciones con el entorno natural y su pervivencia en el territorio.