La declaración de Bahía Portete como área protegida permite proteger ecosistemas con un alto nivel de importancia para la conservación a nivel local, regional y nacional como son: el manglar, las praderas fanerógamas, las formaciones coralinas, playas, fondos blandos someros, pantanos costeros, salitrales y litoral rocoso, ecosistemas donde especies faunísticas desarrollan diferentes etapas de su ciclo de vida, y a su vez brindan sus servicios ecosistémicos a la región.

El PNN BPK tiene una gran importancia considerando la baja representatividad que tienen los ecosistemas marinos y costeros no solamente al nivel nacional sino también global. Corales, aves, langostas, camarones, almejas, ostras, peces como el mero, róbalo, pargo, lisa, lebranche, sierra y sardina, además de reptiles como caimanes y tortugas o mamíferos como erizos, armadillos, murciélagos y zorros. Estas son algunas de las especies de la gran biodiversidad protegida en el Parque que está ubicado en el norte de la península de la Guajira.

En Bahía Portete se encuentran tres especies de mangle, Rhizophora mangle (mangle rojo), Avicennia germinans (mangle negro) y Laguncularia racemosa (mangle blanco). También encontramos tres especies de pastos marinos siendo Thalassia testudinum la mas común y apareciendo Syringodium filiforme y Halodule wrightii en menor proporción. El ecosistema xerofítico que rodea al ambiente costero marino de la bahía presenta escasa diversidad vegetal, sin embargo, se han reportado 19 especies, compuesto principalmente de cactáceas asociadas con árboles y arbustos espinosos de tamaño reducido. Los elementos florísticos más comunes corresponden a los géneros: Capparis, Libidibia, Lemaireocereus, Melocactus, Pereskia, Cereus y Castela (PNN, 2014).

Actividad principal: Sin Ecoturismo
Actividades a desarrollar: Sin Ecoturismo

En el Santuario de Flora y Fauna Bahía Portete, las actividades de conservación están orientadas a preservar los ecosistemas únicos de la región y fomentar la sostenibilidad ambiental junto a las comunidades locales, en especial el pueblo indígena wayúu, cuya cultura y tradición están profundamente conectadas con el territorio. Entre las principales acciones se destacan:

1. Protección de Ecosistemas Estratégicos
   Se implementan medidas para conservar los manglares, praderas de fanerógamas, formaciones coralinas y playas que son cruciales para la biodiversidad. Esto incluye la vigilancia del estado de los ecosistemas y la educación ambiental dirigida a las comunidades locales sobre su importancia.

2. Conservación de la Biodiversidad
   Se realizan esfuerzos para proteger las especies que habitan en Bahía Portete, asegurando que puedan completar las diferentes etapas de sus ciclos de vida, como la reproducción y el refugio en los hábitats disponibles.

3. Gestión de Recursos Naturales
   En colaboración con las comunidades, se promueve el uso sostenible de los recursos marinos y terrestres, integrando prácticas tradicionales wayúu en los planes de manejo del área protegida.

4. Restauración de Hábitats
   Se desarrollan proyectos para recuperar áreas degradadas, especialmente los manglares y los pantanos costeros, con la participación activa de las comunidades locales.

5. Fortalecimiento de la Cultura Local y la Gobernanza Comunitaria
   A través de talleres, encuentros y proyectos de conservación, se fortalecen las capacidades locales para la gestión ambiental, fomentando el liderazgo de las comunidades en la protección del territorio.

6. Monitorización y Educación Ambiental
   Las comunidades participan en programas de monitoreo de especies y ecosistemas, lo que no solo enriquece el conocimiento científico, sino que también crea un sentido de corresponsabilidad.

Estas actividades contribuyen a la protección de los servicios ecosistémicos que Bahía Portete brinda a la región, como la mitigación del cambio climático, la regulación hídrica y la seguridad alimentaria, garantizando un equilibrio entre la conservación ambiental y las necesidades de las comunidades que dependen del área protegida.