Para su funcionamiento, el SIRAP Orinoquia cuenta con un Comité Directivo, un Comité Técnico y una Secretaría Técnica ejercida desde el año 2011 por la Dirección Territorial Orinoquia de Parques Nacionales Naturales de Colombia, las cuales de acuerdo con el reglamento operativo, se reúnen de manera ordinaria así: el Comité Directivo dos (2) veces al año y el Comité Técnico tres (3) veces al año; sin embargo, se pueden realizar reuniones extraordinarias por solicitud de sus miembros.
Desde 2016 y hasta la fecha CORMACARENA preside el Comité Directivo del SIRAP Orinoquia y lo representa ante el Consejo Nacional de Áreas Protegidas – CONAP.
