El área protegida del Santuario se ubica en las estribaciones orientales de la serranía del Darién, específica-mente en la zona marino costera del litoral caribe (Golfo de Urabá), si habláramos de una futura zona amorti-guadora que actualmente es llamada zona de influencia, tendríamos al occidente la cuenca del río Tolo, al occi-dente cercano el humedal de Playona, zona de gran importancia ecosistémica para las especies migratorias y circundantes de la serranía de Caleta y el Darién. Yal sur la desembocadura de la cuenca del río Rionegrito, el cual recoge las aguas del río Chugandí y otros que vierten de la serranía de La Caleta.