Manglares, áreas coralinas, pastos marinos, fondos lodosos, y litoral rocoso y arenoso son ecosistemas de importancia vital para la multiplicidad de especies que viven en el Área Protegida y de los cuales la comunidad Wayuu de la zona devenga bienes y servicios ambientales fundamentales para su pervivencia. Estos ecosistemas quedaron protegidos tras la declaratoria de este Parque Nacional Natural.