En su parte terrestre, el Parque está incluido dentro de dos microcuencas: la microcuenca de McBean, que contiene la mayor parte del área del Parque y donde nacen numerosas corrientes intermitentes cuyas aguas desembocan en el manglar de McBean, y la de Bailey, con sólo una pequeña porción en el área del Parque drenada principalmente por tres arroyos que corren con dirección predominantemente este y noreste, para desembocar en proximidades a los asentamientos de El Valle y Rocky Point.