El PNN Cocuy tiene como principal servicio ambiental la regulación hídrica con influencia en tres cuencas: Arauca, Casanare y Chicamocha, principalmente de las quebradas Playitas, Lagunillas, Cóncavo y Cardenillo que forman el río Nevado. Estas fuentes hídricas pertenecen a la cuenca de Chicamocha y abastecen a más de 11.000 personas. Tiene además otros servicios ambientales como la regulación climática, captación de carbono y conservación de la biodiversidad.