El Programa se implementa en cinco de las seis Direcciones Territoriales de Parques Nacionales Naturales. En su primera fase, beneficia a 18 áreas protegidas adscritas a las Direcciones Territoriales Caribe y Andes Nororientales, abarca los departamentos de La Guajira, Magdalena, Atlántico, Bolívar, Sucre, Cesar, Chocó (alto), San Andrés y Providencia, Norte de Santander, Santander, Arauca y Boyacá, a través del Aporte Financiero No. 2010 65 143, por valor de 15.000.000 de Euros.
La Fase II, cobijada por el Contrato de Aporte Financiero No. 2012 65 685, 19 áreas protegidas más del país, con un aporte financiero de 20.000.000 de Euros, en las regiones Caribe, Andina, Pacífica, y Orinoquia, ubicadas en los departamentos de Bolívar, Córdoba, Norte de Santander, Santander, Caldas, Tolima, Huila, Chocó, Valle del Cauca, Cauca, Nariño, Meta.
FASE I
Áreas Protegidas Priorizadas:
DTCA
- SFF Los Colorados
- SFF El Corchal
- SFF Los Flamencos
- SFF Ciénaga Grande de Santa Marta
- PNN Tayrona
- PNN Old Providence
- PNN Macuira
- PNN Sierra Nevada
- Vía Parque Salamanca
- PNN Bahía Portete
- PNN Corales de Profundidad
- SF Acandí
DTAN
- ANU Los Estoraques
- PNN El Cocuy
- SFF Guanentá Alto Río Fonce
- PNN Tamá
- SFF Iguaque
- PNN Pisba
FASE II
Áreas Protegidas Priorizadas:
DTCA
- PNN Paramillo
- PNN Corales del Rosario y San Bernardo
DTAO
- PNN Los Nevados
- SFF Galeras
- PNN Puracé
- PNN Nevado del Huila
DTAN
- PNN Catatumbo
- PNN Serranía de los Yariguíes
DTOR
- PNN Sumapaz
- PNN Cordillera de los Picachos
- PNN Tinigua
- PNN Sierra de la Macarena
DTPA
- PNN Sanquianga
- PNN Utria
- PNN Los Katíos
- PNN Bahía Málaga
- PNN Gorgona
- PNN Farallones de Cali
- PNN Munchique
