Flora
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En el área es muy común observar los mangles rojo, negro, piñuelo, Zaragoza y bobo, el árbol de corcho, grandes ceibas, cantagallos e higuerones y una gran variedad de vegetación acuática y flotante a lo largo y ancho de los caños y ciénagas. Al interior del Santuario también se encuentran 1.094 hectáreas de vegetación herbácea inundada dominada por gramíneas altas, y áreas homogéneas del helecho “matatigre” localizadas al sur y al oriente del área sobre las planicies de inundación de los caños Correa, Rico, Burro y Portobelo.