Al interior del área se pueden observar gran variedad de aves (153 especies registradas hasta la fecha), entre las cuales se destacan el chavarri, el águila pescadora, el bebehumo, garzas, pelicanos, cormoranes, gran variedad de loros y aves de humedales. Asì mismo posee un buen número de especies de mamíferos como la zorra manglera, el poncho o chigüiro, el mono aullador, el mico tití y la guartinaja.