De las especies de fauna reportadas para el Parque, las más carismáticas son: el oso de anteojos Tremarctos ornatus y el colibrí de zamarros de Munchique Eriocnemis mirabilis, especies que se encuentran amenazadas de extinción, la primera en estado Vulnerable (VU) y la segunda en peligro (EN), según la UICN; y las más representativas: el venado conejo (Pudu mephistophiles), el Tigrillo Leopardus tigrinus) y el Mono Nocturno o Tutamono, Aotus lemurinus, con grado de amenaza Vulnerable (VU) y el Mono Araña, Ateles fuscipes con grado de amenaza en Peligro Crítico (CR).