Las corrientes de agua del Parque Catatumbo Barí drenan principalmente al río Catatumbo que desemboca al Lago de Maracaibo en Venezuela.

La red hidrográfica, está conformada principalmente por los ríos Catatumbo, Río de Oro, el río Intermedio, las quebradas de Bakdrom Boki, Dukuboki, Saynuboki, Sanonoboki, Batuyboki, Batuinaboki. A la parte baja del río de Oro llegan los caños Tomas y Eusebio. Además son de importancia entre los afluentes de la parte baja del Catatumbo los caños San Miguel, El Martillo, El Brandy, El Indio y el Tarra.