A partir de los muestreos realizados al interior del DNMI, con el apoyo de la Fundación Orinoquia Biodiversa – FOB, se registraron 670 especies de plantas.  Las coberturas herbáceas nativas son las que mayor extensión cubren dentro del área y corresponden al bioma predominante en la zona; dichas coberturas se pueden diferenciar en dos grandes grupos: herbazales altos densos de tierra firme y herbazales densos altos, medios y bajos inundables.  En cuanto a coberturas arbóreas sobresalen los bosques de galería que cubren las riberas de los ríos, con presencia de morichales abiertos y mixtos, saladillales y congriales.  Para el área se identifica la ceiba tolúa (Pachira quinata) como una especie en categoría de amenaza (VU- UICN Global – EN – MADS 2017 – EN – UICN Nacional ).

Se reportan tres especies de la familia Arecaceae que de acuerdo con la guía de campo de palmas de Colombia (Galeano & Bernal 2010) no figuran con distribución geográfica para esta zona del país, estas especies son: Astrocaryum jauari, Astrocaryum acaule y Bactris bidentula.  La vegetación de esta región se caracteriza por comunidades diferentes a otras regiones de la Orinoquia y también se evidencia la presencia de una flora relictual pleistocénica, dominada por taxones de afinidad amazónica y guayanesa (Schargel y Aymard 1993, Aymard y González 2014, FOB 2016).