Objetivos de Conservación del Parque Nacional Natural Alto Fragua Indi Wasi

1. Proteger muestras de los orobiomas andino y subandino de la cordillera Oriental, y de zonobioma húmedo tropical de piedemonte amazónico.
   
   
2. Contribuir al mantenimiento de la integridad ecológica y conectividad de ecosistemas andino-amazónico mediante la protección de muestras de los ecosistemas: bosque andino en montaña fluvio erosional, bosque subandino en montaña fluvio erosional y bosque basal en montaña fluvio erosional.
   
   
3. Contribuir a la conservación del hábitat de especies con distribución geográfica restringida y especies amenazadas a nivel global y nacional presentes en el PNN Alto Fragua Indi Wasi.
   
   
4. Mantenimiento de los servicios ambientales que proveen las cuencas de los ríos Pescado, Fragua Chorroso, Yurayaco, y Fragua Grande; estratégicas  para el abastecimiento de agua en el sur occidente del departamento del Caquetá.
   
   
5. Proteger elementos naturales asociados a la permanencia del conocimiento y la  diversidad cultural.